Fue establecida en 1990 mediante el Acuerdo No. 013 del Honorable Concejo Municipal, impulsada por la dedicación de los miembros de la Banda 20 de Septiembre, con el objetivo de preservar y consolidar el prestigio musical que la banda ha ganado para el municipio de Puerres. Inició sus actividades con los instrumentos de la Banda, los cuales posteriormente se integraron a la Escuela de Música Floresmilo Flores. Gracias a esfuerzos continuos, se ha logrado adquirir más instrumentos necesarios para el desarrollo de la práctica musical.
La escuela de música Floresmilo Flores recibe respaldo financiero de la alcaldía municipal, lo cual asegura la remuneración de los profesores, talleristas y un fondo destinado al mantenimiento de los instrumentos.
El nombre de la escuela rinde homenaje al distinguido maestro y compositor puerreño, el padre Floresmilo Flores. Este ilustre músico es reconocido por obras como Cisnes del Lago, A orillas del Guaitara, Muerte tranquila y otras composiciones que han trascendido fronteras gracias a su genialidad musical.